对于商标侵权行为，当事人可以根据不同的情况选择向工商行政管理机关投诉或者向人民法院起诉。
一、工商行政管理机关对于商柝侵权行为的查处
由于商标侵权行为不仅仅损害商标注册人的合法权益，也损害了正常的商标管理秩序和经济秩序，因此《商标法》赋予工商行政管理机关查处商标侵权行为的职责，工商行政管理机关可以通过市场检查等手段，查处商标侵权行为，也可以根据商标注册人的投诉或者其他人的举报，查处商标侵权行为。
工商行政管理机关查处商标侵权行为的特点：
（一）程序简单
只要当事人提供最基本的商标侵权的证据与线索，有管辖权的工商行政管理机关就可以立案，并且进行调查处理
（二）证据要求低、当事人举证较容易
工商行政管理机关在处理商标侵权行为时可以对当事人提供的证据进行调查核实，不必要求当事人事事举证，因而证据要求不如法院审判民事案件那样高，当事人承担的举证责任也较轻。
（三）投诉费用较低
工商行政管理机关在查处商标侵权时或者在立案、调查、处理时，不收取当事人的费用。
（四）效率较高
由于工商行政管理机关是目前我国经济领域覆盖范围最广、网络最大的经济管理机关，并且经过多年的实践，建立了一支有一定商标管理经验的专业人员队伍，几乎遍布城乡每一个角落，可以对于处于各个领域的、大大小小的各种商标侵权行为实施有效的打击。因此，商标当事人如果善于运用工商行政管理机关的作用，可有效地制止商标侵权行为。尤其是针对一些简单的、分散的商标侵权案件，处理速度较快。
（五）力度有限
受工商行政管理机关行政权力的限制，工商行政管理机关处理商标侵权案件有时会感到力不从心。如对于赔偿问题，仅仅只能进行调解工作，不具有强制性，往往不能有效地补偿当事人所受到的损失。
根据以上特点，商标注册人可以将一些商标侵权事实清楚、案情简单、标的小的案件，向工商行政管理机关投诉。
二、人民法院对于商标侵权行为的审判
当事人也可以向人民法院起诉侵权人的商标侵权行为，由人民法院作为知识产权案件或者民事案件处理。法院对商标案件的审判具有以下特点：
（一）重程序
当事人在向人民法院起诉或者在应诉中，必须严格按诉讼程序的要求起诉或者应诉，否则，可能不予受理或者败诉。
（二）重证据
商标诉讼原则上，也是要遵循“谁主张，谁举证”的原则，由当事人承担举证责任，提供证据，否则，可能要承担举证不利的后果。
（三）诉讼费用
法院会根据诉讼标的大小，收取一定的诉讼费用。这些费用往往要由败诉方承担。但事先要由起诉方先行支付。如聘用律师，当事人还要承担不少的律师费用。
（四）强制力
法院的判决，具有很高的强制力，比较容易得到执行，可以比较好地实现对商标侵权行为的制止和补偿受到的损失，因此，效果较好。
（五）效率有限
但由于法院从立案到审判以及判决，往往需要较长的时间，因此审判效率有限。
根据以上特点，商标注册人可以将一些案情复杂、标的大的案件，向人民法院起诉。
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